10月15日，世嘉与Creative Assembly宣布，《全面战争：幕府将军2》完全版已暂时下架。世嘉表示，本作表现未能达到玩家预期，也没有达到自身标准，官方认同游戏体验未达到应有水平，正与各大游戏平台合作，在调查问题期间重新上架原版游戏。
截至目前，本作在Steam的简体中文评测为“差评如潮”。玩家反馈集中在画面升级，大量玩家质疑开发团队使用了效果欠佳的AI放大处理；据3DM游戏报道，一张单位卡片对比引发讨论，原版中留胡子的骑马武士在新版画面里，鼻子和胡须被形容得像另一种头盔形状，部分新增图像还被质疑出现六指等异常。
技术层面，玩家记录了原版已有的漏洞和新版出现的新故障，还有较多反馈认为新版运行表现不如旧版。据Notebookcheck报道，有用户报告在RTX 5090显卡上以4K分辨率游玩时仅获得30至40帧。新版本增加了50个可操作势力，但部分玩家认为这些势力缺乏足够独特的机制，整体平衡性也存在问题。